Mike J Mwanga 1, Betty E Owor 2, John B Ochieng 3, Mwanajuma H Ngama 2, Billy Ogwel 3, Clayton Onyango 4 4, Jane Juma 3, Regina Njeru 2, Elías Gicheru 2, Grieven P Otieno 2, Sammy Khagayi 3, Charles N Agoti 2, Godfrey M Bigogo 3, Richard omore 3Oh Oh , Addo 5 5, Seheri Mapaseka 6 6, Jacqueline E Tate 7 7, Umesh Parashar D 7 7, Elizabeth Hunsperger 4 4, Jennifer R Verani 4 4, Robert F Breiman 5 5, D James Nokes 8 9
Resumen
Antecedentes: Kenia introdujo la vacuna monovalente G1P [8] Rotarix® en el calendario de vacunación infantil en julio de 2014. Examinamos las tendencias en la distribución del genotipo del grupo A del rotavirus (RVA) antes (enero de 2010-junio de 2014) y después (julio de 2014- Diciembre de 2018) Introducción de la vacuna RVA.
Métodos: Se recolectaron muestras de heces de niños <13 años de cuatro sitios de vigilancia en Kenia: el Hospital del Condado de Kilifi, la Clínica Tabitha de Nairobi, el Hospital de la Misión Lwak y el Hospital de Referencia del Condado de Siaya (niños de <5 años solamente). Las muestras se seleccionaron para determinar la presencia de RVA utilizando un ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA) y los genes VP7 y VP4 secuenciados para inferir genotipos.
Resultados: Genotipamos 614 muestras en pre-vacuna y 261 en períodos de introducción post-vacuna. Durante el período de introducción previo a la vacuna, los genotipos de RVA más frecuentes fueron G1P [8] (45.8%), G8P [4] (15.8%), G9P [8] (13.2%), G2P [4] (7.0%) y G3P [6] (3,1%). En el período de introducción posterior a la vacuna, los genotipos más frecuentes fueron G1P [8] (52,1%), G2P [4] (20,7%) y G3P [8] (16,1%). Los genotipos predominantes variaron según el año y el sitio, tanto en los períodos previos como posteriores a la vacuna. Los patrones de genotipos temporales mostraron un aumento en la prevalencia de los genotipos heterotípicos de vacunas, como el G2P similar a DS-1 [4] (7.0 a 20.7%, P <.001) y G3P [8] (1.3 a 16.1%, P < .001) genotipos en el período de introducción posterior a la vacuna. Además, observamos una disminución en la prevalencia de los genotipos G8P [4] (15.8 a 0.4%, P <.001) y G9P [8] (13.2 a 5.4%, P <.001) en el período de introducción posterior a la vacuna. El análisis filogenético del genotipo G1P [8], reveló la circulación de cepas de los linajes G1-I, G1-II y P [8] -1, P [8] -III y P [8] -IV. Se observó una diversidad genética considerable entre las cepas pre y post vacuna, evidenciada por distintos grupos.
Conclusión: la prevalencia del genotipo varió de antes a después de la introducción de la vacuna. Tales observaciones enfatizan la necesidad de vigilancia a largo plazo para monitorear el impacto de la vacuna. Estos cambios pueden representar una variación secular natural o posibles cambios inmunoepidemiológicos derivados de la introducción de la vacuna. La secuenciación completa del genoma podría proporcionar información sobre las presiones evolutivas posteriores a la vacuna y la diversidad antigénica.
Palabras llave : genotipo; Kenia; Post-vacuna; Pre-vacuna; Rotavirus
Declaracion de conflicto de interes
Los autores declaran no tener conflictos de intereses.
Cifras
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