Mayor riesgo de reinfección por SARS-CoV-2 asociado con la aparición de la variante Omicron en Sudáfrica

Abstracto

Objetivo Examinar si el riesgo de reinfección por SARS-CoV-2 ha cambiado a lo largo del tiempo en Sudáfrica, en el contexto de la aparición de las variantes Beta, Delta y Omicron.

Diseño Análisis retrospectivo de datos de vigilancia epidemiológica de rutina

Establecer la lista de datos de la línea sobre el SARS-CoV-2 con fechas de recepción de muestras entre el 4 de marzo de 2020 y el 27 de noviembre de 2021, recopilados a través del Sistema Nacional de Vigilancia de Condiciones Médicas Notificables de Sudáfrica

Participantes 2,796,982 individuos con SARS-CoV-2 confirmado por laboratorio que tuvieron un resultado positivo en la prueba al menos 90 días antes del 27 de noviembre de 2021. Se consideró que las personas que tenían pruebas positivas secuenciales separadas por al menos 90 días tenían sospechas de reinfecciones.

Principales medidas de resultado Incidencia de sospechas de reinfecciones a lo largo del tiempo; comparación de las tasas de reinfección con la expectativa bajo un modelo nulo (enfoque 1); estimaciones empíricas de los riesgos de infección y reinfección que varían en el tiempo a lo largo de la epidemia (enfoque 2)

Resultados Se identificaron 35,670 sospechas de reinfecciones entre 2,796,982 individuos con SARS-CoV-2 confirmado por laboratorio que tuvieron un resultado positivo en la prueba al menos 90 días antes del 27 de noviembre de 2021. El número de reinfecciones observadas hasta el final de la tercera ola fue consistente con el modelo nulo de ningún cambio en el riesgo de reinfección (enfoque 1). Aunque se observaron aumentos en el riesgo de infección primaria después de la introducción de las variantes Beta y Delta, no se observó un aumento correspondiente en el riesgo de reinfección (enfoque 2). Contrariamente a lo esperado, el cociente de riesgo estimado para la reinfección frente a la infección primaria fue menor durante las oleadas impulsadas por las variantes Beta y Delta que para la primera oleada (cociente de riesgo relativo para la oleada 2 frente a la oleada 1: 0,75 (IC 95: 0,59-0,97); para la oleada 3 frente a la oleada 1: 0,71 (IC 95 : 0,56–0,92)). Por el contrario, la propagación reciente de la variante Omicron se ha asociado con una disminución en el coeficiente de riesgo de infección primaria y un aumento en el coeficiente de riesgo de reinfección. El cociente de riesgo estimado de reinfección frente a infección primaria para el período comprendido entre el 1 de noviembre de 2021 y el 27 de noviembre de 2021 frente al ciclo 1 fue de 2,39 (IC 95 : 1,88–3,11).

Conclusión La evidencia a nivel de población sugiere que la variante Omicron está asociada con una capacidad sustancial para evadir la inmunidad de una infección previa. En contraste, no hay evidencia epidemiológica en toda la población de escape inmunológico asociado con las variantes Beta o Delta. Este hallazgo tiene importantes implicaciones para la planificación de la salud pública, particularmente en países como Sudáfrica con altas tasas de inmunidad a infecciones previas. Sigue habiendo preguntas urgentes sobre si Omicron también es capaz de evadir la inmunidad inducida por la vacuna y las posibles implicaciones de la inmunidad reducida a la infección en la protección contra enfermedades graves y la muerte.

Caja 1

Qué es lo que ya se sabe sobre este tema

Qué es lo que ya se sabe sobre este tema

  • Se estima que una infección previa con SARS-CoV-2 proporciona al menos una reducción del 80% del riesgo de infección ( 1 , 2 ).

  • Los estudios de laboratorio indican una neutralización reducida por suero convaleciente para las variantes Beta y Delta en relación con el virus de tipo salvaje ( 3 – 6 ); sin embargo, se desconoce el impacto de estas reducciones en el riesgo de reinfección, y las evaluaciones de laboratorio de Omicron aún están en curso.

Lo que agrega este estudio

Lo que agrega este estudio

  • Proporcionamos dos métodos para monitorear las tendencias de reinfección para identificar firmas de cambios en el riesgo de reinfección.

  • No encontramos evidencia de un mayor riesgo de reinfección asociado con la circulación de variantes Beta o Delta en comparación con la cepa ancestral en los datos epidemiológicos de rutina de Sudáfrica.

  • En contraste, encontramos evidencia clara a nivel de población que sugiere una evasión inmune sustancial por parte de la variante Omicron.

Resumen de una oración El análisis de los datos de vigilancia de rutina de Sudáfrica sugiere que, a diferencia de Beta y Delta, la variante Omicron del SARS-CoV-2 demuestra evidencia sustancial a nivel de población de la evasión de la inmunidad de una infección previa.

Declaración de intereses en competencia

Todos los autores han completado el formulario de divulgación uniforme del ICMJE. CC y AvG han recibido financiación de Sanofi Pasteur en los últimos 36 meses. JRCP y KM forman parte del Comité Asesor Ministerial sobre COVID-19 del Departamento Nacional de Salud de Sudáfrica. Los autores no han declarado otras relaciones o actividades que puedan parecer haber influido en el trabajo presentado.

Declaración de financiación

Este trabajo fue apoyado por el Departamento de Ciencia e Innovación de Sudáfrica y la Fundación Nacional de Investigación y el Wellcome Trust (subvención número 221003 / Z / 20 / Z) en colaboración con la Oficina de Relaciones Exteriores, Commonwealth y Desarrollo del Reino Unido.

Declaraciones del autor

Confirmo que se han seguido todas las pautas éticas relevantes y que se han obtenido las aprobaciones necesarias del IRB y / o del comité de ética.

Los detalles del IRB / organismo de supervisión que otorgó la aprobación o la exención para la investigación descrita se proporcionan a continuación:

Este estudio recibió la autorización ética de la Universidad de Witwatersrand (número de certificado de autorización M210752, anteriormente M160667) y la aprobación bajo revisión recíproca de la Universidad de Stellenbosch (ID de proyecto 19330, Número de referencia de ética N20 / 11 / 074_RECIP_WITS_M160667_COVID-19).

Confirmo que se ha obtenido todo el consentimiento necesario del paciente / participante y que se han archivado los formularios institucionales apropiados, y que los identificadores de paciente / participante / muestra incluidos no eran conocidos por nadie (por ejemplo, personal del hospital, pacientes o participantes) fuera de la investigación. grupo, por lo que no se puede utilizar para identificar individuos.

Entiendo que todos los ensayos clínicos y cualquier otro estudio prospectivo de intervención deben registrarse en un registro aprobado por el ICMJE, como ClinicalTrials.gov. Confirmo que cualquier estudio de este tipo informado en el manuscrito se ha registrado y se proporciona el ID de registro del ensayo (nota: si publica un estudio prospectivo registrado retrospectivamente, proporcione una declaración en el campo de ID del ensayo explicando por qué el estudio no se registró por adelantado) .

He seguido todas las pautas de informes de investigación apropiadas y he cargado las listas de verificación de informes de investigación de la Red EQUATOR y otro material pertinente como archivos complementarios, si corresponde.

Papel de la colección COVID-19 SARS-CoV-2 preprints de medRxiv y bioRxiv

FUENTE: para leer el artículo cliquear aquí

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