La asociación temporal de la introducción y el levantamiento de intervenciones no farmacéuticas con el número de reproducción variable en el tiempo ( R ) del SARS-CoV-2: un estudio de modelado en 131 países

Publicado en el VOLUMEN 21, NÚMERO 2P193-202,01 DE FEBRERO DE 2021 pero originalmente en octubre 2020

Publicado: 22 de octubre de 2020 https://doi.org/10.1016/S1473-3099(20)30785-4

Resumen

Fondo

Muchos países implementaron intervenciones no farmacéuticas (NPI) para reducir la transmisión del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), el agente causal de COVID-19. Se ha informado de un resurgimiento de casos de COVID-19 en algunos países que levantaron algunas de estas NPI. Nuestro objetivo era comprender la asociación de la introducción y el levantamiento de las NPI con el nivel de transmisión del SARS-CoV-2, medido por el número de reproducción variable en el tiempo ( R ), desde una perspectiva amplia en 131 países.

Métodos

En este estudio de modelado, vinculamos datos sobre estimaciones diarias a nivel de país de R de la London School of Hygiene & Tropical Medicine (Londres, Reino Unido) con datos sobre políticas específicas de cada país sobre NPI de Oxford COVID-19 Government Response Tracker, disponible entre el 1 de enero y el 20 de julio de 2020. Definimos una fase como un período de tiempo en el que todas las NPI se mantuvieron iguales y dividimos el cronograma de cada país en fases individuales según el estado de las NPI. Calculamos la relación R como la relación entre la R diaria de cada fase y la R del último día de la fase anterior (es decir, antes de que cambiara el estado del NPI) como una medida de la asociación entre el estado del NPI y la transmisión del SARS-CoV. -2. Luego modelamos la Rratio utilizando una regresión log-lineal con introducción y relajación de cada NPI como variables independientes para cada día de los primeros 28 días después del cambio en el NPI correspondiente. En un análisis ad-hoc, estimamos el efecto de reintroducir múltiples NPI con los mayores efectos, y en la secuencia observada, para abordar el posible resurgimiento del SARS-CoV-2.

Recomendaciones

Se incluyeron en el análisis 790 fases de 131 países. Se encontró una tendencia decreciente a lo largo del tiempo en la proporción R luego de la introducción del cierre de escuelas, el cierre del lugar de trabajo, la prohibición de eventos públicos, los requisitos para quedarse en casa y los límites de movimiento interno; la reducción en R varió del 3% al 24% el día 28 después de la introducción en comparación con el último día antes de la introducción, aunque la reducción fue significativa solo para la prohibición de eventos públicos ( razón R 0 · 76, 95% CI 0 · 58-1 · 00); para todas las demás NPI, el límite superior del IC del 95% estaba por encima de 1. Una tendencia creciente a lo largo del tiempo en el Rla proporción se encontró luego de la relajación del cierre de escuelas, prohibiciones de eventos públicos, prohibiciones de reuniones públicas de más de diez personas, requisitos para quedarse en casa y límites de movimiento interno; el aumento en R varió del 11% al 25% el día 28 después de la relajación en comparación con el último día antes de la relajación, aunque el aumento fue significativo solo para la reapertura de la escuela ( razón R 1 · 24, IC del 95% 1 · 00–1 · 52) y levantamiento de las prohibiciones de reuniones públicas de más de diez personas (1 · 25, 1 · 03–1 · 51); para todos los demás NPI, el límite inferior del IC del 95% fue inferior a 1. Después de la introducción de un NPI, tomó una mediana de 8 días (IQR 6-9) observar el 60% de la reducción máxima en Re incluso más tiempo (17 días [14-20]) después de la relajación para observar el 60% del aumento máximo en R . En respuesta a un posible resurgimiento de COVID-19, se estimó que una estrategia de control de prohibición de eventos públicos y reuniones públicas de más de diez personas reduciría R , con una relación R de 0 · 71 (95% CI 0 · 55–0 · 93) el día 28, disminuyendo a 0 · 62 (0 · 47–0 · 82) el día 28 si se añadieron medidas para cerrar los lugares de trabajo, 0 · 58 (0 · 41–0 · 81) si las medidas para cerrar los lugares de trabajo y se agregaron restricciones de movimiento, y 0 · 48 (0 · 32–0 · 71) si se agregaron medidas para cerrar lugares de trabajo, restricciones de movimiento interno y requisitos para permanecer en el hogar.

Interpretación

Las NPI individuales, incluido el cierre de escuelas, el cierre del lugar de trabajo, la prohibición de eventos públicos, la prohibición de reuniones de más de diez personas, los requisitos para quedarse en casa y los límites de movimiento interno, están asociados con una transmisión reducida del SARS-CoV-2, pero el efecto de la introducción y el levantamiento de estos NPI se retrasa entre 1 y 3 semanas, y este retraso es más prolongado cuando se levantan los NPI. Estos hallazgos proporcionan evidencia adicional que puede informar las decisiones de los responsables de la formulación de políticas sobre el momento de introducir y levantar diferentes ISFL, aunque R debe interpretarse en el contexto de sus limitaciones conocidas.

Fondos

Fondo de apoyo estratégico institucional de Wellcome Trust e iniciativa de innovación impulsada por datos.

Investigación en contexto

Evidencia antes de este estudio
El número de reproducción variable en el tiempo ( R ; también conocido como t ), definido por el número esperado de casos secundarios que surgen de un caso primario infectado en el momento t , es una métrica que describe la transmisión viral a nivel de población. Un valor de R por encima de 1 indica un brote creciente, y un valor de R por debajo de 1 indica un brote que se está reduciendo. Se realizaron búsquedas en PubMed, medRxiv y bioRxiv en busca de estudios que informaran los efectos de la introducción y el levantamiento de intervenciones no farmacéuticas (NPI) en Rdel síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) publicado entre el 1 de enero y el 5 de agosto de 2020, utilizando las palabras clave “COVID-19”, “SARS-CoV-2”, “intervención” y “transmisión”. No se aplicó ninguna restricción de idioma. Los estudios en China, Hong Kong, Corea del Sur, Singapur y muchos países europeos mostraron que varias NPI, incluido el cierre de escuelas, el distanciamiento físico y el encierro, podrían reducir R sustancialmente a cerca o por debajo de 1. Sin embargo, se sabe poco sobre los efectos en R después de la relajación de estos NPI.
Valor agregado de este estudio
Hasta donde sabemos, este estudio es el primero en cuantificar explícitamente los efectos tanto de la introducción como de la eliminación de las NPI individuales en R a lo largo del tiempo. Al vincular un conjunto de datos globales de valores R diarios a nivel de país con un conjunto de datos globales de políticas a nivel de país sobre ISFL, modelamos el cambio en los valores de R (como razón R ) desde el día 1 al día 28 luego de la introducción y relajación de ocho ISFL entre 131 países. Descubrimos que la reapertura de escuelas, el levantamiento de la prohibición de eventos públicos, el levantamiento de la prohibición de reuniones públicas de más de diez personas, el levantamiento de los requisitos para quedarse en casa y el levantamiento de los límites de movimiento interno se asociaron con un aumento en Rdel 11 al 25% el día 28 después de la relajación. Sin embargo, los efectos de introducir y eliminar las NPI no fueron inmediatos; tomó una mediana de 8 días (IQR 6-9) después de la introducción de las NPI para observar el 60% de su reducción máxima en R e incluso más (17 días [14-20]) después de la relajación para observar el 60% del máximo aumentar en R . También se identificó un retraso similar en respuesta a la introducción y relajación de las NPI utilizando los datos de movilidad de Google. Comparamos cuatro candidatos diferentes de NPI compuestos que los países podrían considerar en respuesta a un posible resurgimiento de COVID-19.
Implicaciones de toda la evidencia disponible
Cuantificamos el cambio en la transmisión del SARS-CoV-2, medido por R , después de la introducción y relajación de los NPI individuales, y encontramos un retraso de 1 a 3 semanas en la observación de los efectos de la introducción y el levantamiento de estos NPI. Estos hallazgos proporcionan evidencia adicional que puede informar las decisiones de los responsables de la formulación de políticas sobre qué ISFL introducir o eliminar y cuándo esperar un efecto notable después de la introducción o la relajación.

Introducción

El nuevo coronavirus síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) que se informó por primera vez en Wuhan (China) en diciembre de 2019, se ha extendido por todo el mundo y, a partir del 21 de octubre de 2020, la pandemia resultante de COVID-19 se había propagado. causó más de 40 millones de casos confirmados y más de 1 millón de muertes (ver Panel de control COVID-19). Desde principios de marzo de 2020, se introdujeron intervenciones no farmacéuticas (NPI) a nivel de población para reducir la transmisión del SARS-CoV-2 en muchos países afectados por COVID-19, y estas han incluido cierres de escuelas, prohibiciones de eventos públicos, restricciones a la reunión. tamaños y requisitos para quedarse en casa. Desde principios de mayo de 2020, varios países han comenzado a levantar algunas de estas NPI, y algunos países han sido testigos de un segundo aumento en el número de casos de COVID-19 notificados. En respuesta al resurgimiento, varios países han reintroducido las NPI para reducir la transmisión del SARS-CoV-2. Es importante comprender el impacto de la introducción y el levantamiento de estas NPI en la transmisión del SARS-CoV-2.
El número de reproducción variable en el tiempo ( R ; también conocido como t ) se define por el número esperado de casos secundarios que surgen de un caso primario infectado en el tiempo t . R es una métrica importante para medir la transmisibilidad específica en el tiempo y podría usarse para evaluar si las intervenciones actuales parecen ser efectivas o si se requieren intervenciones adicionales. Si R permanece por debajo de 1, las epidemias eventualmente desaparecerán; si R es superior a 1, se esperan epidemias sostenidas.

Los estudios en China, Hong Kong, Corea del Sur, Singapur y muchos países europeos mostraron que varias NPI, incluido el cierre de escuelas, el distanciamiento físico y el encierro, podrían reducir R sustancialmente a cerca o por debajo de 1.

Sin embargo, hay pocos datos disponibles sobre los efectos sobre R después de la relajación de estos NPI. Nuestro objetivo fue evaluar la asociación temporal entre la introducción y el levantamiento de diferentes NPI y los niveles de transmisión del SARS-CoV-2, medidos por R , en 131 países.

Métodos

 Fuentes de datos

En este estudio de modelado, incluimos datos sobre estimaciones de R a nivel de país del proyecto EpiForecasts de la Escuela de Higiene y Medicina Tropical de Londres (Londres, Reino Unido).

Brevemente, el número de reproducción instantánea se estima en base a los recuentos diarios de casos confirmados de COVID-19 informados por el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. El número de reproducción instantánea representa el número promedio de casos secundarios que surgirían de un caso primario infectado en un momento dado si las condiciones permanecieran idénticas después de ese tiempo, y por lo tanto mide la transmisibilidad instantánea.

El marco de modelado tiene en cuenta el retraso en la notificación entre el inicio de los síntomas y la notificación del caso, el truncamiento correcto de las fechas de notificación y el retraso entre el inicio y la infección según los datos empíricos para garantizar que las variaciones temporales en R se puedan comparar directamente con los momentos en que se implementaron las NPI. .

Incluimos datos sobre las políticas específicas de cada país sobre las NPI del Rastreador de respuestas gubernamentales COVID-19 de Oxford (OxCGRT).

OxCGRT fue establecido por un equipo dedicado de expertos en políticas públicas y gobernanza, que recopilan información disponible públicamente sobre indicadores de respuesta del gobierno. En OxCGRT, las NPI se agrupan en las siguientes ocho categorías: cierre de escuelas, cierre de lugares de trabajo, prohibición de eventos públicos (por ejemplo, eventos deportivos, festivos y religiosos), restricciones sobre el tamaño de las reuniones, cierre del transporte público, quedarse en casa pedidos, restricciones al movimiento interno y restricciones a los viajes internacionales. La información específica de cada país sobre cada una de las NPI está disponible a diario (desde el 1 de enero de 2020). También incluimos datos sobre políticas de pruebas y rastreo de contactos de cada país de OxCGRT para análisis de sensibilidad.

 Procesamiento de datos

Vinculamos los R y NPI conjuntos de datos por país y la fecha para generar nuestra base de datos de trabajo, que contiene una serie temporal de diarios R estimaciones y el estado de las ocho intervenciones no farmacéuticas para 131 países entre Enero de 1 y el 20 de julio de 2020. Detalles sobre el inicio y Las fechas de finalización de nuestro conjunto de datos de trabajo para cada país están disponibles en el apéndice (págs. 2–4 ).
Las variables originales para las NPI en el conjunto de datos OxCGRT eran ordinales, que iban desde “ninguna intervención” (0 puntos) hasta “recomendar intervención” (1 punto) y luego “requerir intervención” (2 puntos). Para este estudio, convertimos estas variables de NPI en una variable binaria fusionando las variables «no intervención» y «intervención recomendada» para aumentar el poder estadístico del análisis. Los detalles de la conversión de cada variable NPI están disponibles en el apéndice (págs. 5-6 ).

 Análisis de los datos

Definimos una fase como un período de tiempo en el que las ocho NPI permanecieron iguales, y dividimos el cronograma de cada país en fases individuales según el estado de las NPI. Primero describimos la duración de las fases, la frecuencia de introducción y levantamiento de cada NPI y el orden temporal de introducción y levantamiento de cada NPI. Para cada fase, definimos día i como el R del i- ésimo día de esa fase (es decir, desde que cambió el estado del NPI) y definimos día 0 como el R del último día de su fase anterior (es decir, antes de la El estado de NPI cambió). Como se espera que el efecto de las NPI sobre la transmisión (medido como R ) sea relativo a su nivel original, calculamos elRelación R entre día i y día 0 como medida del grado de asociación de la introducción y el levantamiento de un NPI (o NPI) con la transmisión del SARS-CoV-2 ( figura 1 ). Una relación R de más de 1 indica un aumento en la transmisión desde el cambio en el NPI (o NPI), y una relación R de menos de 1 indica una disminución en la transmisión. Sobre la base del cambio de las NPI entre dos fases vecinas y la relación R correspondiente , pudimos evaluar el efecto de introducir o eliminar cada una de las NPI.

Figura miniatura gr1
Figura 1 Cálculo de presentación esquemática de la relación R
En el análisis principal, modelamos la razón R utilizando una regresión log-lineal, con la siguiente ecuación, para cada día de los primeros 28 días posteriores al cambio en el NPI correspondiente (es decir, un total de 28 modelos separados):
log (Yt=βt0+βt1Xt1+βt2Xt2… +βtdieciséisXtdieciséis+βt17Zt1+βt18Zt2Iniciar sesión(Yt)=β0t+β1tX1t+β2tX2t+…+βdieciséistXdieciséist+β17tZ1t+β18tZ2t
donde t representa la relación R en el día t ( t = 1, 2,…, 28);
Xt1aXtdieciséisX1taXdieciséist
son indicadores binarios de si cada una de las ocho NPI se introducen y levantan, respectivamente; y
Zt1yZt2Z1tyZ2t
son indicadores binarios de si se introducen y levantan múltiples NPI simultáneamente, respectivamente. Por eso,
βt0β0t
representa el cambio de línea de base en R el día t en ausencia de cambios en el estado de NPI;
βt1Oβtdieciséisβ1ttoβdieciséist
representar los efectos individuales de la introducción y el levantamiento de las NPI en el día t , respectivamente; y
βt17Oβt18β17ttoβ18t
representan la interacción entre la introducción y el levantamiento, respectivamente, de múltiples NPI a medida que se introducen y levantan simultáneamente. No se incluyeron días más allá de los primeros 28 días posteriores al cambio debido a la disponibilidad limitada de datos.
Sobre la base de las estimaciones del modelo, para cada NPI, calculamos el tiempo en días necesario para alcanzar el 60% de su efecto máximo (medido por la razón R , que debía ser <0 · 95 o> 1 · 05) en los primeros 28 días como medida de inmediatez. Además, modelamos el total de visitas a lugares de trabajo y el tiempo total pasado en áreas residenciales utilizando datos de movilidad de Google aplicando el mismo modelo de regresión que para el análisis principal entre 101 países (detalles en el apéndice p 7 ). Comparamos los resultados de inmediatez de introducir y levantar el cierre del lugar de trabajo entre usar la relación R y usar el total de visitas a los lugares de trabajo. También comparamos los resultados inmediatos de la introducción y el levantamiento de requisitos para permanecer en casa entre el uso de R ratio y utilizando el tiempo total pasado en zonas residenciales.
Hicimos una serie de análisis de sensibilidad. Primero, reemplazamos la NPI de una prohibición de reuniones de más de diez personas con una prohibición de reuniones de más de 100 personas en el modelo para comprender cómo la limitación de reuniones públicas de diferentes tamaños podría afectar la transmisión. En segundo lugar, presentamos el efecto de las NPI individuales al incluir solo las fases en las que solo se cambió una NPI. En tercer lugar, usamos un comparador diferente, la R media para los 7 días antes del cambio de estado de NPI (en lugar de R para el día anterior al cambio de estado de NPI), al calcular el Rproporción. En cuarto lugar, excluimos las primeras fases en las que se introdujo la primera NPI del país. En quinto lugar, excluimos los países grandes que podrían tener una mayor variabilidad regional en las políticas de NPI: Brasil, Canadá, China, India, Rusia y Estados Unidos. En sexto lugar, hicimos 20 conjuntos de análisis, cada uno de los cuales excluyó al azar a diez países del conjunto de datos, para comprender cómo nuestras estimaciones se habían visto afectadas por posibles valores atípicos. Séptimo, incluimos solo las fases con pruebas integrales (definidas como el requisito de evaluar a cualquier persona con síntomas de COVID-19) en el análisis, ya que la práctica de las pruebas podría afectar la estimación de R. En octavo lugar, incluimos solo las fases con rastreo de contactos completo (definido como el requisito de rastrear contactos para todos los casos de COVID-19) para comprender cómo el rastreo de contactos podría modificar el efecto de las NPI en nuestro modelo.
Además, sobre la base del efecto modelado de las NPI individuales de nuestro análisis principal, hicimos un análisis ad-hoc para estimar el efecto de reintroducir múltiples NPI (aquellas con los mayores efectos y siguiendo la secuencia observada de introducir NPI) para abordar las posibles resurgimiento del SARS-CoV-2. Consideramos cuatro estrategias candidatas para la reintroducción: la candidata 1 incluía la prohibición de eventos públicos y reuniones de más de diez personas; el candidato 2 incluía el cierre del lugar de trabajo, así como la prohibición de eventos públicos y reuniones de más de diez personas; el candidato 3 incluía el cierre del lugar de trabajo, la prohibición de eventos públicos y reuniones de más de diez personas y límites de movimiento interno; y el candidato 4 incluyó el cierre de escuelas y lugares de trabajo, una prohibición de eventos públicos y reuniones de más de diez personas, límites de movimiento interno,
Todos los análisis y visualización de datos se realizaron en el software R (versión 3.6.1). Los códigos R y el conjunto de datos de trabajo correspondiente utilizado para los análisis están disponibles en GitHub.

 Papel de la fuente de financiación

Los patrocinadores del estudio no tuvieron ningún papel en el diseño del estudio, la recopilación de datos, el análisis de datos, la interpretación de los datos, la redacción del manuscrito o la decisión de enviarlo para su publicación. Todos los autores tuvieron acceso completo a todos los datos del estudio y fueron responsables de la decisión de enviar el manuscrito para su publicación.

Resultados

Se incluyeron en el análisis 790 fases de 131 países (consulte el apéndice págs. 8–40 para obtener detalles sobre las estimaciones diarias de R y el estado del NPI para cada país). La mediana de duración de las fases fue de 11 días (IQR 3-27), y la mediana de duración más corta se observó en las fases en las que el cierre de escuelas (3 días [1-8]) y la prohibición de eventos públicos (4 días [2-7]) fueron introducidos ( apéndice p 41 ). Los requisitos para permanecer en casa y las restricciones a los movimientos internos fueron las ISFL más comunes introducidas, y con mayor frecuencia se introdujeron y levantaron simultáneamente ( figura 2). Con respecto a la secuencia temporal de introducción y levantamiento de las NPI, el cierre de escuelas y las prohibiciones de eventos públicos fueron las dos primeras NPI introducidas y se levantaron más tarde que la mayoría de las NPI. Los requisitos de permanecer en casa y el cierre del transporte público fueron las dos últimas NPI introducidas y se eliminaron antes que la mayoría de las NPI ( figura 2 ).

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Figura 2 Frecuencia (A) y orden (B) de introducción y levantamiento de NPI

De acuerdo con los resultados del análisis principal, se encontró una tendencia decreciente a lo largo del tiempo en la razón R en los primeros 14 días posteriores a la introducción del cierre de escuelas, cierre de lugares de trabajo, prohibiciones de eventos públicos, requisitos para quedarse en casa y límites de movimiento interno ( figura 3 ); la reducción de R osciló entre el 3% y el 24% el día 28 después de la introducción ( tabla 1 ). La introducción de una prohibición de eventos públicos se asoció con la mayor reducción de R ; la relación R fue 0 · 90 (95% CI 0 · 82–0 · 99) el día 7, 0 · 83 (0 · 68–1 · 00) el día 14 y 0 · 76 (0 · 58–1 · 00) el día 28 ( tabla 1 ). Una tendencia creciente a lo largo del tiempo en la Rla proporción se encontró después de la relajación del cierre de escuelas, la prohibición de eventos públicos, la prohibición de reuniones públicas de más de diez personas, los requisitos para quedarse en casa y los límites de movimiento interno, especialmente después de la primera semana después de la relajación; el aumento de R osciló entre el 11% y el 25% el día 28 después de la relajación ( figura 3 ). La relajación del cierre de la escuela se asoció con el mayor aumento de R en el día 7 ( relación R 1 · 05, IC del 95% 0 · 96–1 · 14) y el día 14 (1 · 18, 1 · 02–1 · 36) . La relajación de la prohibición de reuniones de más de diez personas se asoció con el mayor aumento de R el día 28, con una Rproporción de 1 · 25 (95% CI 1 · 03–1 · 51) el día 28. Se identificó interacción negativa, es decir, hacia una proporción R de 1, cuando se introdujeron o eliminaron múltiples NPI simultáneamente ( apéndice p 42 ).

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Figura 3 Cambio a lo largo del tiempo en la relación R después de la introducción y relajación de las NPI individuales
Tabla 1 Cambio en la relación R a lo largo del tiempo el día 7, el día 14 y el día 28 después de la introducción y relajación de cada NPI
Día 7 Día 14 Día 28
Cierre de la escuela
Introducción 0 · 89 (0 · 82–0 · 97) 0 · 86 (0 · 72–1 · 02) 0 · 85 (0 · 66–1 · 10)
Relajación 1 · 05 (0 · 96–1 · 14) 1 · 18 (1 · 02–1 · 36) 1 · 24 (1 · 00–1 · 52)
Cierre del lugar de trabajo
Introducción 0 · 89 (0 · 83–0 · 96) 0 · 89 (0 · 78–1 · 02) 0 · 87 (0 · 73–1 · 03)
Relajación 1 · 04 (0 · 97–1 · 13) 1 · 10 (0 · 97–1 · 24) 1 · 01 (0 · 83–1 · 25)
Prohibición de eventos públicos
Introducción 0 · 90 (0 · 82–0 · 99) 0 · 83 (0 · 68–1 · 00) 0 · 76 (0 · 58–1 · 00)
Relajación 1 · 02 (0 · 93–1 · 11) 1 · 07 (0 · 92–1 · 24) 1 · 21 (0 · 97–1 · 50)
Prohibición de reuniones de más de diez personas.
Introducción 0 · 93 (0 · 87–0 · 99) 0 · 98 (0 · 87–1 · 10) 0 · 97 (0 · 83–1 · 14)
Relajación 0 · 99 (0 · 93–1 · 06) 1 · 07 (0 · 96–1 · 20) 1 · 25 (1 · 03–1 · 51)
Cierre de transporte público
Introducción 0 · 97 (0 · 91–1 · 04) 0 · 98 (0 · 87–1 · 11) 0 · 99 (0 · 84–1 · 18)
Relajación 1 · 00 (0 · 93–1 · 07) 1 · 08 (0 · 96–1 · 22) 1 · 04 (0 · 85–1 · 27)
Requisitos para quedarse en casa
Introducción 0 · 90 (0 · 85–0 · 97) 0 · 89 (0 · 79–1 · 00) 0 · 97 (0 · 83–1 · 14)
Relajación 0 · 97 (0 · 91–1 · 03) 1 · 02 (0 · 92–1 · 13) 1 · 11 (0 · 94–1 · 32)
Límites de movimiento interno
Introducción 0 · 97 (0 · 90–1 · 03) 0 · 97 (0 · 87–1 · 10) 0 · 93 (0 · 79–1 · 10)
Relajación 0 · 98 (0 · 92–1 · 04) 1 · 06 (0 · 95–1 · 18) 1 · 13 (0 · 94–1 · 37)
Límites de viajes internacionales
Introducción 0 · 89 (0 · 81–0 · 98) 0 · 97 (0 · 81–1 · 16) 1 · 08 (0 · 85–1 · 38)
Relajación 0 · 95 (0 · 84–1 · 07) 1 · 02 (0 · 81–1 · 28) 0 · 98 (0 · 68–1 · 40)
Los datos son la relación R (IC del 95%). Para cada NPI, el período de referencia es el día anterior a la introducción o relajación de ese NPI. Una relación R de más de 1 indica una transmisión aumentada y una relación R de menos de 1 indica una transmisión disminuida. NPI = intervención no farmacéutica. R = número de reproducción variable en el tiempo.
La inmediatez del efecto al introducir y levantar las NPI fue diferente. Los efectos de introducir y eliminar las NPI no fueron inmediatos; tomó una mediana de 8 días (IQR 6-9) después de la introducción de un NPI para observar el 60% de la reducción máxima en R e incluso más (17 días [14-20]) después de su relajación para observar el 60% de la aumento máximo de R ( apéndice p. 43 ). Se observaron retrasos similares para el cierre del lugar de trabajo y los requisitos de permanecer en casa cuando se usa R , así como cuando se usan los datos de movilidad de Google ( apéndice p 44 ). Con los datos de movilidad de Google, tomó aproximadamente 6 días y 12 días (en comparación con 6 días y 9 días cuando se usa R) después de la introducción y relajación del cierre del lugar de trabajo, respectivamente, para observar el 60% del cambio máximo en el total de visitas al lugar de trabajo, y tomó un estimado de 6 días y 17 días (en comparación con 6 días y 23 días cuando se usa R ) después la introducción y relajación de los requisitos para permanecer en casa, respectivamente, para observar el 60% del cambio máximo en el tiempo total de permanencia en áreas residenciales.

Al comparar el efecto de una prohibición de reuniones de más de diez personas con el de una prohibición de reuniones de más de 100 personas, encontramos que ambas prohibiciones se asociaron con una disminución en la proporción R en la primera semana, seguida de un aumento. en la relación R a partir de la segunda semana, pero el aumento fue más pronunciado para la prohibición de reuniones de más de 100 personas, con relaciones R superiores a 1 después del día 14 ( figura 4 ). Al levantar estas dos prohibiciones, observamos un aumento tardío de R para la prohibición de reuniones de más de diez personas ( apéndice p. 45 ); el día 14, la RLa proporción fue 1 · 07 (95% CI 0 · 96–1 · 20) para levantar la prohibición de reuniones de más de diez personas y 1 · 23 (1 · 07–1 · 42) para levantar la prohibición de reuniones de más de 100 personas ( figura 4 ).

Miniatura de la figura gr4
Figura 4 Cambio a lo largo del tiempo en la relación R después de la introducción y relajación de una prohibición de reuniones públicas de diferentes tamaños
Se observaron resultados similares en términos de la tendencia en R a lo largo del tiempo después de la introducción y relajación de las NPI (aunque con IC más amplios debido a la escasez de datos) a partir de análisis de sensibilidad que incluyeron solo fases durante las cuales solo se cambió una NPI ( apéndice p 46 ), utilizado la R media de los últimos 7 días (en lugar del último día) en la fase anterior para calcular la razón R ( apéndice p 47 ), excluyó las fases iniciales cuando se introdujo el primer NPI del país ( apéndice p 48 ), excluyó siete países grandes que podrían tener una mayor variabilidad regional en las políticas de NPI ( apéndice p 49 ), se excluyeron diez países al azar ( apéndice p 50), incluyó solo fases con pruebas completas ( apéndice p 51 ) e incluyó solo fases con rastreo de contactos completo ( apéndice p 52 ). Contrariamente al análisis principal, encontramos que si no se introdujo una prohibición de eventos públicos como primera intervención, se mostró una reducción no significativa en R el día 28, con una razón R de 0 · 80 (IC del 95%: 0 · 57 –1 · 11).

Sobre la base de los resultados del análisis principal, estimamos los efectos de cuatro candidatos de ISFL compuestas ( tabla 2 ; apéndice p 53 ). Las mayores reducciones en R se observaron para el candidato 4 (cierre de la escuela y el lugar de trabajo, además de la prohibición de eventos públicos y reuniones de más de diez personas, límites de movimiento interno y el requisito de quedarse en casa) en todos los momentos ( tabla 2 ).

Tabla 2 Cambio modelado en la relación R a lo largo del tiempo el día 7, el día 14 y el día 28 después de la introducción de diferentes compuestos de NPI
Día 7 Día 14 Día 28
Candidato 1: prohibición de eventos públicos y reuniones de más de diez personas 0 · 94 (0 · 85–1 · 03) 0 · 87 (0 · 73–1 · 05) 0 · 71 (0 · 55–0 · 93)
Candidato 2: cierre del lugar de trabajo más prohibición de eventos públicos y reuniones de más de diez personas 0 · 84 (0 · 76–0 · 93) 0 · 78 (0 · 64–0 · 94) 0 · 62 (0 · 47–0 · 82)
Candidato 3: Cierre del lugar de trabajo más prohibición de eventos públicos y reuniones de más de diez personas más límites de movimiento interno 0 · 81 (0 · 71–0 · 92) 0 · 76 (0 · 60–0 · 95) 0 · 58 (0 · 41–0 · 81)
Candidato 4: Cierre de la escuela y el lugar de trabajo más prohibición de eventos públicos y reuniones de más de diez personas más límites de movimiento interno más el requisito de quedarse en casa 0 · 65 (0 · 54–0 · 78) 0 · 58 (0 · 42–0 · 78) 0 · 48 (0 · 32–0 · 71)
Los datos son la relación R (IC del 95%). El período de referencia es el día anterior a la introducción de una NPI. Una relación R de más de 1 indica una transmisión aumentada y una relación R de menos de 1 indica una transmisión disminuida. NPI = intervención no farmacéutica. R = número de reproducción variable en el tiempo.

Discusión

A nuestro leal saber y entender, este estudio es el primero en evaluar la asociación temporal entre el cambio de estado de una serie de NPI y la transmisión del SARS-CoV-2, medida por R , para todos los países para los que se disponía de datos. Sobre la base de los datos empíricos de 131 países, encontramos que las NPI individuales, incluido el cierre de escuelas, el cierre del lugar de trabajo, la prohibición de eventos públicos, los requisitos para permanecer en el hogar y los límites de movimiento interno, se asociaron con reducciones en Rde 3 a 24% el día 28 después de su introducción, en comparación con el día antes de su introducción. La reapertura de escuelas, el levantamiento de las prohibiciones de eventos públicos, el levantamiento de las prohibiciones de reuniones públicas de más de diez personas, el levantamiento de los requisitos para quedarse en casa y el levantamiento de los límites de movimiento interno se asociaron con aumentos en R del 11-25% el día 28 después de la relajación. Los efectos de introducir y eliminar las NPI no fueron inmediatos; tomó alrededor de 1 semana después de la introducción de un NPI para observar el 60% de la reducción máxima en R e incluso más (casi 3 semanas) después de la relajación de un NPI para observar el 60% del aumento máximo en R. Nuestro análisis sugiere que, en el contexto de un resurgimiento del SARS-CoV-2, una estrategia de control de prohibición de eventos públicos y reuniones públicas de más de diez personas se asociaría con una reducción en R del 6% el día 7, 13% el día 14 y el 29% el día 28; si esta estrategia también incluye el cierre de los lugares de trabajo, la reducción general de R sería del 16% el día 7, el 22% el día 14 y el 38% el día 28. Estos hallazgos proporcionan evidencia adicional que puede informar las decisiones de los responsables de la formulación de políticas sobre el tiempo de introducir y levantar diferentes NPI.

Nuestros hallazgos sobre los efectos de la introducción de NPI coincidieron en líneas generales con los hallazgos del estudio multipaís de Flaxman y colegas que evaluó el impacto de diferentes NPI en 11 países europeos.

Flaxman y sus colegas informaron que varias NPI (por ejemplo, el cierre de escuelas y la prohibición de eventos públicos), y el cierre en particular, tuvieron un gran efecto (81%) en la reducción de la transmisión.

Sin embargo, Flaxman y sus colegas no evaluaron los cambios a lo largo del tiempo en el efecto del bloqueo y asumieron que el efecto fue inmediato. En este estudio, estimamos que una intervención extrema similar al encierro, consistente en el cierre de escuelas y lugares de trabajo, prohibiciones de eventos y reuniones públicas, requisitos para permanecer en casa y límites en el movimiento interno, podría reducir R en un 35% el día 7, 42% el día 14 y 52% el día 28. Nuestros hallazgos sobre los efectos de la introducción de NPI también fueron cualitativamente similares a los de un estudio de Islam y sus colegas que modeló la tasa de incidencia de COVID-19 con datos de OxCGRT NPI,

aunque ese estudio no evaluó los efectos de levantar las NPI.

Nuestro análisis demuestra que el efecto de introducir y eliminar las NPI no fue inmediato y que el tiempo necesario para alcanzar ciertos niveles de efecto difirió según la NPI. Este hallazgo proporciona evidencia importante a los formuladores de políticas sobre cuándo esperar un efecto notable al introducir o levantar una NPI. El retraso del efecto observado podría explicarse por la inercia del comportamiento, que está respaldada por los resultados de inmediatez similares de las NPI entre el uso de R y el uso de datos de movilidad de Google.

El cierre de escuelas fue ampliamente adoptado anteriormente para controlar los brotes de influenza y las pandemias, y se demostró que reduce y retrasa los picos de epidemias.

Para el SARS-CoV-2, el papel de los niños en su transmisión aún no está claro. Un estudio de modelado de China mostró que el cierre de escuelas por sí solo no podía interrumpir la transmisión, pero podría reducir potencialmente la incidencia máxima en un 40-60% y retrasar la epidemia de COVID-19.

En este estudio, demostramos que el cierre de las escuelas por sí solo podría disminuir la transmisión en un 15% ( razón R 0 · 85, 95% CI 0 · 66–1 · 10) el día 28 y la reapertura de las escuelas podría aumentar la transmisión en un 24% (1 · 24 , 1 · 00-1 · 52) el día 28. Debe reconocerse que en nuestro análisis, no pudimos tener en cuenta las diferentes precauciones con respecto a la reapertura de escuelas que fueron adoptadas por algunos países, como el distanciamiento físico dentro de las aulas (p. Ej., Limitar tamaño de las clases y la colocación de separadores transparentes entre los estudiantes) y fuera de las aulas (p. ej., distancia física durante las comidas, recreación y transporte), higiene mejorada (p. ej., limpieza profunda de rutina y lavado personal de manos y mascarillas), y otros (p. ej., temperatura térmica controles a la llegada).

Tales precauciones son imperativas para una reapertura de escuelas más segura. Se informó de un brote de COVID-19 en una escuela secundaria en Israel 10 días después de su reapertura; los estudiantes estaban en aulas abarrotadas y no se les indicó que usaran mascarillas debido a las altas temperaturas.

Además, cabe señalar que no consideramos las vacaciones escolares normales en algunos países. Tampoco pudimos evaluar el efecto de la reapertura de diferentes niveles de la escuela (p. Ej., Escuelas primarias frente a secundarias) ya que el efecto podría diferir por franjas de edad más finas dentro de los niños y adolescentes en edad escolar.

Un informe encontró que los niños menores de 5 años con COVID-19 leve a moderado tenían cargas virales altas en la nasofaringe en comparación con los niños mayores y los adultos y, por lo tanto, podrían ser potencialmente importantes impulsores de la transmisión en la población general.

Nuestros hallazgos sugieren que, como un único NPI, la prohibición de eventos públicos resultó en la mayor reducción de R , con un índice de R el día 28 de 0 · 76 (95% CI 0 · 58–1 · 00). Este hallazgo no es sorprendente porque la prohibición de actividades concurridas podría evitar eventos de superpropagación, que se informaron comúnmente al comienzo de la pandemia de COVID-19.

Otra explicación de la alta reducción es que la prohibición de eventos públicos fue a menudo la primera NPI que se introdujo en los países; nuestro análisis de sensibilidad que excluyó las NPI que se introdujeron primero mostró una reducción no significativa de la transmisión con la prohibición de eventos públicos, con un índice R de 0 · 80 (IC del 95%: 0 · 57–1 · 11) el día 28.

Nuestros hallazgos también sugieren que, en 28 días, levantar las prohibiciones de eventos públicos podría aumentar la transmisión en un 21%, aunque el hallazgo no fue significativo, y levantar las prohibiciones de reuniones de más de diez personas podría aumentar la transmisión en un 25%, que fue el aumento más alto. entre todas las NPI. No observamos una reducción sustancial en la transmisión después de la introducción de prohibiciones en reuniones de más de diez o más de 100 personas, especialmente para más de 100 personas, lo que mostró un aumento en la transmisión después del día 14; Las posibles explicaciones para este hallazgo incluyen una baja adherencia y, para la prohibición de reuniones de más de 100 personas, un aumento en las reuniones a menor escala. Además, debe tenerse en cuenta que para las prohibiciones de las reuniones físicas, no pudimos estratificar aún más nuestro análisis por entornos interiores o exteriores debido a la escasez de datos.

En particular, no observamos una diferencia sustancial en nuestros resultados cuando incluimos en un análisis de sensibilidad solo las fases con un rastreo de contactos completo. Esto no fue como se esperaba ya que se creía que el rastreo de contactos reducía la transmisión mediante la identificación temprana de casos infecciosos. Este hallazgo podría deberse a la falta de representatividad, ya que solo el 18% de nuestros datos se incluyeron en este análisis de sensibilidad. Sin embargo, un estudio de modelado, que podría explicar nuestros resultados, sugirió que una estrategia de rastreo de contactos contribuirá a la contención de COVID-19 solo si se puede organizar de manera oportuna para minimizar las demoras en las pruebas y el rastreo.

Sin embargo, nuestros datos carecían de la granularidad necesaria para explorar más a fondo la puntualidad de las pruebas y el seguimiento. Además, de manera similar a los hallazgos de Islam y sus colegas,

no observamos efectos sustanciales del cierre del transporte público en la relación R.

Nuestro estudio tiene algunas ventajas. Primero, tanto el método para el cálculo de R como el método para registrar las ISFL se mantuvieron consistentes a lo largo del tiempo entre diferentes países, lo que aseguró la comparabilidad entre las diferentes fases en diferentes países en nuestro análisis. En segundo lugar, al dividir el cronograma en diferentes fases de acuerdo con los cambios en las NPI, pudimos evaluar el efecto de las NPI individuales. En tercer lugar, pudimos estimar el cambio en el efecto de las ISFL a lo largo del tiempo.

Reconocemos varios desafíos y limitaciones con respecto a nuestro análisis. Primero, nuestro análisis se basó en datos sobre políticas de control más que en el comportamiento real de la población. En particular, no pudimos explicar la creciente conciencia de la higiene personal (incluido el uso de cubiertas para la cara) entre el público en respuesta a la pandemia. Estos cambios de comportamiento conducen a una mayor reducción de la transmisión y es probable que varíen con el tiempo. Tampoco pudimos examinar el cumplimiento de estas NPI debido a la escasez de datos adecuados que fueran confiables en todos los países a lo largo del tiempo. En segundo lugar, algunas NPI (por ejemplo, el cierre de escuelas y la prohibición de eventos públicos) a menudo se introdujeron antes que otras NPI (por ejemplo, requisitos para quedarse en casa); por lo tanto, no pudimos evaluar el efecto de diferentes órdenes de clasificación de cambios en el estado de la NPI.R y, por lo tanto, podría sesgar las estimaciones para las NPI posteriores. En tercer lugar, nuestros datos sobre las R y las NPI estaban a nivel nacional, mientras que tanto las R como las NPI podían variar entre las diferentes partes de un país. Un aumento en R a nivel nacionalpodría deberse a un brote agrupado en algunas áreas o debido a varios casos dispersos en todo el país. En cuarto lugar, reconocimos la heterogeneidad potencialmente alta entre los diferentes países en términos de determinación de casos de NPI y COVID-19. Nuestros hallazgos deben considerarse como un resumen amplio de todo el conjunto de datos, y no teníamos la intención de sacar conclusiones por separado para países individuales. Nuestros análisis de sensibilidad indicaron que nuestros principales hallazgos no fueron sensibles a la eliminación de diferentes listas de países. En quinto lugar, la conciencia individual y la higiene personal han ido cambiando con el tiempo desde que comenzó la pandemia, lo que podría contribuir en gran medida al cambio en la transmisión del SARS-CoV-2 (por ejemplo, el uso de mascarillas era poco común antes de la pandemia de COVID-19); por lo tanto, el impacto en Rpor la futura reintroducción y nueva relajación de las NPI podría ser sustancialmente diferente. En sexto lugar, no consideramos el papel de la estacionalidad subyacente o los factores meteorológicos (por ejemplo, temperatura y humedad) en la transmisión del SARS-CoV-2. Un estudio de modelado encontró que la introducción de NPI estaba fuertemente asociada con el crecimiento de casos de COVID-19 y, en comparación, la humedad solo se asoció débilmente con el crecimiento; no se encontró asociación para la latitud o la temperatura.

En séptimo lugar, solo evaluamos el efecto de la introducción y el levantamiento de las NPI durante los primeros 28 días después de la introducción y la relajación, y los hallazgos (incluida la tendencia) no deben generalizarse más allá de los 28 días. Finalmente, aunque nuestro estudio podría considerarse esencialmente como un estudio experimental natural,

nuestros hallazgos no implican necesariamente causalidad.

Reconocemos varias limitaciones de la metodología para la estimación R utilizada en nuestro análisis. En primer lugar, el ajuste por demoras en los informes solo se realizó a nivel mundial y no fue específico para cada país debido a la escasez de datos disponibles sobre demoras en los informes. Esto podría conducir a una inexactitud temporal de R , lo que podría sesgar nuestros hallazgos sobre la inmediatez de los cambios en R asociados con las NPI. No obstante, nuestros hallazgos sobre la inmediatez de los cambios asociados con las NPI fueron consistentes con los resultados del análisis utilizando datos de movilidad de Google, lo que indica que la posible inexactitud temporal de R podría haber tenido poco impacto en los hallazgos generales. En segundo lugar, la RLa estimación estaba sujeta a la especificación de parámetros (por ejemplo, período de incubación y tiempo de generación de SARS-CoV-2) en el modelo y podría estar sesgada hacia arriba o hacia abajo. Sin embargo, creemos que es poco probable que este sesgo afecte los principales hallazgos de nuestro estudio porque usamos la razón R como la métrica de salida (que cancela todos los elementos invariantes en el tiempo relacionados con la estimación R ). En tercer lugar, el marco de modelización para R no pudo dar cuenta del cambio a lo largo del tiempo en la elegibilidad para las pruebas, el método de prueba o la definición de caso en diferentes países. Esto podría sesgar tanto la estimación R como la Rratio en nuestro análisis para las fechas durante las cuales se produjeron los cambios. Por ejemplo, es probable que observemos un aumento artificial en R si un país aumenta la capacidad de prueba en un período corto. Por último, el rango de incertidumbre de la estimación de R nacional se basó en el número de casos notificados a nivel nacional y, por lo tanto, no reflejó ninguna variación en R dentro del país.

También reconocemos las limitaciones innatas de R como medida de transmisión del SARS-CoV-2. Primero, aunque a menudo se asume que R tiene interpretaciones sencillas en la práctica, estimar R durante un brote en curso es complicado y está asociado con una incertidumbre sustancial. En segundo lugar, las estimaciones de R se vuelven poco fiables con un rango de incertidumbre más amplio si el número de casos es bajo, lo que reduce su aplicabilidad a nivel local o cuando el número de casos en una región grande es bajo. En tercer lugar, R puede ser sensible a un aumento en el número de casos en ciertos entornos (p. Ej., Residencias, escuelas, fábricas y hospitales) y no representa completamente la transmisión en la población general. Cuatro,R es una medida de transmisión a nivel de población promedio y no refleja la transmisión a nivel individual del SARS-CoV-2. El potencial de transmisión del SARS-CoV-2 varía entre individuos y se refleja en los eventos de superpropagación notificados.

En resumen, nuestros hallazgos brindan evidencia adicional que puede informar las decisiones de los formuladores de políticas sobre el momento de introducir y levantar diferentes NPI. Las decisiones de reintroducir y relajar las restricciones deben basarse en varios factores, incluida la capacidad y la resistencia del sistema de atención de salud, y en algunos países es mejor tomarlas a nivel provincial o de distrito que a nivel nacional.
Colaboradores
YL, HC y HN conceptualizaron el estudio. YL llevó a cabo la adquisición, el análisis y la visualización de datos. HN, HC e YL lideraron la interpretación de los datos con una contribución sustancial de DK, AH, MN y XW. YL redactó el borrador del informe, y todos los demás autores revisaron el informe de manera crítica en busca de contenido intelectual importante. Todos los autores han leído y aprobado la versión final del informe. YL y HN verificaron el vínculo de datos de dos conjuntos de datos disponibles públicamente y tuvieron acceso completo a los datos vinculados.
Declaración de intereses
YL reporta subvenciones de la OMS, fuera del trabajo presentado. HC informa subvenciones de la Iniciativa de Medicamentos Innovadores, el Instituto Nacional de Investigación en Salud del Reino Unido y la Fundación Bill y Melinda Gates, y subvenciones y honorarios personales de la OMS y Sanofi, fuera del trabajo presentado. HN informa subvenciones de la Iniciativa de Medicamentos Innovadores, la OMS y el Instituto Nacional de Investigaciones Sanitarias; honorarios personales de la Fundación Bill y Melinda Gates, Janssen y AbbVie; y subvenciones y honorarios personales de Sanofi y la Foundation for Influenza Epidemiology, fuera del trabajo presentado. Todos los demás autores declaran no tener intereses en competencia.

Compartir datos

Los datos del estudio y los códigos R correspondientes están disponibles gratuitamente con publicación en GitHub en https://github.com/leoly2017/COVID_NPI_R .
Expresiones de gratitud
Este estudio fue financiado por el Fondo de apoyo estratégico institucional de Wellcome Trust y la iniciativa de innovación impulsada por datos. Agradecemos a Gerry Fowkes (Universidad de Edimburgo, Edimburgo, Reino Unido) del grupo UNCOVER por sus comentarios sobre el borrador del informe.

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